| Место в рейтинге | Наименование долгосрочной целевой программы |
Государственный заказчик (координатор) | Численное значение рейтинга эффективности в баллах |
| 1 | "Социальная поддержка инвалидов в Республике Карелия" на период 2008-2011 годов | Министерство здравоохранения и социального развития Республики Карелия | 4,3 |
| 2 | "Улучшения демографической ситуации Республики Карелия на период 2008-2010 годов и до 2015 года" | Министерство здравоохранения и социального развития Республики Карелия | 4,15 |
| 3 | "Пожарная безопасность в Республике Карелия на период до 2012 года" | Государственный комитет Республики Карелия по обеспечению жизнедеятельности и безопасности населения | 4,05 |
| 4 | "Гармонизация национальных и конфессиональных отношений, формирование гражданского согласия в Республике Карелия на 2007-2011 годы" | Министерство Республики Карелия по вопросам национальной политики и связям с религиозными объединениями | 3,1 |
| 5 | "Развитие кадрового потенциала Республики Карелия" на период 2008-2012 годов | Государственный заказчик - Министерство труда и занятости Республики Карелия | 2,95 |
| 6 | "Дети Карелии" на 2008-2011 годы | Министерство здравоохранения и социального развития Республики Карелия | 2,65 |
| 7 | "Развитие сферы культуры в Республике Карелия на период до 2012 года" | Министерство культуры и по связям с общественностью Республики Карелия | 2,5 |
| 8 | "Патриотическое воспитание граждан Российской Федерации, проживающих на территории Республики Карелия" на 2008-2011 годы | Министерство образования Республики Карелия | 2,5 |
| 9 | "Профилактика правонарушений в Республике Карелия на 2006-2010 годы" | МВД по Республике Карелия | 2,45 |
| 10 | "Информатизация Республики Карелия на 2008-2012 года" | Государственный заказчик | 2,225 |
| 11 | "Развитие малого и среднего предпринимательства в Республике Карелия на период до 2014 года" | Министерство экономического развития Республики Карелия | 2,0 |
| 12-13 | "Государственная поддержка карельского, вепсского и финского языков в Республике Карелия на 2006-2010 годы" | Министерство Республики Карелия по вопросам национальной политики и связям с религиозными объединениями | 1,9 |
| 12-13 | "Здоровый образ жизни" на период 2005-2007 годов и до 2010 года" | Министерство здравоохранения и социального развития Республики Карелия | 1,9 |
| 14 | "Радиационная безопасность населения и территории Республики Карелия на 2008-2011 годы" | Государственный комитет Республики Карелия по обеспечению жизнедеятельности и безопасности населения | 1,5 |
| 15 | "Развитие дорожного хозяйства Республики Карелия на период до 2015 года" | Министерство строительства Республики Карелия | 1,45 |
| 16 | "Развитие агропромышленного комплекса Республики Карелия на период до 2012 года" | Министерство сельского, рыбного хозяйства и экологии Республики Карелия | 1,4 |
| 17 | "Развитие физической культуры и спорта в Республике Карелия на 2006- 2010 годы" | Государственный комитет Республики Карелия по физической культуре и спорту | 1,15 |
| 18-20 | "Повышение безопасности дорожного движения в Республике Карелия на 2006-2010 годы" | Министерство строительства Республики Карелия | 1,0 |
| 18-20 | "Развитие туризма в Республике Карелия на период до 2010 года" | Министерство экономического развития Республики Карелия | 1,0 |
| 18-20 | "Сохранение генофонда карельской березы и воспроизводство ее ресурсов на территории Республики Карелия на 2008-2015 годы" | Министерство лесного комплекса Республики Карелия | 1,0 |
| 21-24 | "Жилище" на 2004-2010 годы | Министерство строительства Республики Карелия | 0,5 |
| 21-24 | "Социальное развитие села Республики Карелия до 2010 года" | Министерство сельского, рыбного хозяйства и экологии Республики Карелия | 0,5 |
| 21-24 | "Экология и природные ресурсы Республики Карелия на 2004-2010 годы" | Министерство сельского, рыбного хозяйства и экологии Республики Карелия | 0,5 |
| 21-24 | "Реформирование и модернизация жилищно-коммунального хозяйства Республики Карелия на 2004-2010 годы" | Государственный комитет Республики Карелия по реформированию жилищно-коммунального хозяйства | 0,5 |
| 25 | "Развитие территориальной автоматизированной системы оповещения населения Республики Карелия на 2006-2010 годы" | Государственный комитет Республики Карелия по обеспечению жизнедеятельности и безопасности населения | 0,3 |